外国貿易に対応できる近代的な港として築港の建設が明治30年(1897年)に大阪市によって始められました。赤レンガ倉庫は、その最終段階、大正12 年(1923年)に竣工されました。昭和3年(1928年)には鉄道が開通し、赤レンガ倉庫は貨物列車の発着駅となり、日本および海外各地を結ぶ貨客船 への貨物の積み降ろしが行われていました。当時、赤レンガ倉庫は重要な物流拠点として機能していました。
戦後、昭和40年代(1965年〜)になると、貨物の運搬はコンテナおよびコンテナ船が主流となり、赤レンガ倉庫は次第に物流拠点としての価値を減じて いきました。というのは、コンテナは貨物を納めた移動式の倉庫であるために、従来の倉庫は必要とされなくなったのでした。
平成11年(1999年)には倉庫としての役目を終え、大阪市の管理にうつり、現在へと至っています。